En el marco del proceso de integración económica centroamericana, existen diversos instrumentos en materia de medidas sanitarias y fitosanitarias (MSF) que ha sido aprobados por las Partes del Subsistema de Integración Económica Centroamericana.
Estos instrumentos se han agrupado temáticamente para referencia y convenciencia de los usuario.
- Reglamento Centroamericano sobre Medidas y Procedimientos Sanitarios y Fitosanitarios
- Directriz Sanitaria y Fitosanitaria Centroamericana para Facilitar el Comercio de Envíos y Mercancías
- Procedimiento de Control e Inspección de Envíos, Mercancías e Insumos Agropecuarios en los Puestos de Control Cuarentenario
- RTCA 67.06.74:16 Productos agropecuarios orgánicos. Requisitos para la producción, procesamiento, comercialización, certificación y etiquetado

- RTCA 65.05.67:18 Insumos Agrícolas. Ingrediente Activo Grado Técnico, Plaguicidas Químicos Formulados, Sustancias Afines, Coadyuvantes y Vehículos Físicos de Uso Agrícola. Requisitos para la Elaboración de Etiquetas y Panfletos
- RTCA 65.03.44:07 Plaguicidas. Plaguicidas de uso doméstico y de uso profesional. Requisitos de registro
- RTCA 65.03.57:10 Plaguicidas. Plaguicidas de uso doméstico y de uso profesional. Requisitos de etiquetado
- RTCA 65.05.54:15 Fertilizantes y enmiendas de uso agrícola. Requisitos para el Registro
- RTCA 65.05.61:16 Plaguicidas Microbiológicos de Uso Agrícola. Requisitos de Registro
- RTCA 65.05.62:11 Plaguicidas Botánicos de Uso Agrícola. Requisitos para el Registro


- RTCA 65.05.53:10 Requisitos para la producción y comercialización de semilla certificada de granos básicos y soya
- RTCA 65.05.34:06 Registro de Variedades Comerciales. Requisitos de Inscripción

- RTCA 65.05.51:18 Medicamentos veterinarios y productos afines. Registro sanitario y control
- RTCA 65.05.52:11 Productos utilizados en alimentación animal y establecimientos. Requisitos de registro sanitario y control
- RTCA 65.05.63:11 Productos utilizados en Alimentación Animal. Buenas Prácticas de Manufactura y su lista de verificación de BPM
Procedimientos de Reconocimiento de Registros
- Procedimiento de reconocimiento de registro sanitario de medicamentos veterinarios y productos afines en la región
- Procedimiento de Reconocimiento de Registro de Fertilizantes y enmiendas de uso agrícola
- Procedimiento de reconocimiento registro de alimentos para animales
